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| Registros recuperados : 199 | |
| 13. |  | CHAIA, G.; CHIARI, L.; SILVA, D. C.; GUEREIRO, J. Closantel (R 31.520) no tratamento da Dermatobia hominis (Lineu Jr., 1781). Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 16, n. 2, p. 193-197, mar. 1981 Título em inglês: Closantel (R 31.520) in the treatment of "bernes" (Dermatobia hominis) (Lineu Jr. 1781).| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 14. | | KRUG, L. D.; CHIARI, L.; JANK, L.; LAURA, V. A. Avaliação do transcriptoma de Panicum maximum Jacq. em resposta ao déficit hídrico. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 10., 2014, Campo Grande, MS. [Anais da..]. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2014. p. 62-63. 2 p. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 208). Comissão organizadora: Grácia Maria Soares Rosinha, Alexandra Rocha de Oliveir, Rodrigo Carvalho Alva.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 18. | | FERREIRA, R. C. U. (; CHIARI, L.; SOUZA, A. P. Transferibilidade de marcadores microssatélites entre espécies do gênero Urochloa. WORKSHOP MELHORAMENTO VEGETAL, 2., 2016, Campo Grande, MS. Contribuições, Avanços e perspectivas para o Cerrado brasileiro. Anais... Campo Grande, MS: SBMP, 2016.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 19. | | LEGUIZAMON, G. O. de C.; CHIARI, L.; JANK, L. Uso de RAPD para confirmação da identidade de genótipos de Panicum maximum Jacq. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 5., 2009, Guarapari. O melhoramento e os novos cenários da agricultura: anais. Vitória: Incaper, 2009. 1 CD-ROM. (Incaper. Documentos, 11). CBMP 2009. Organizado por Romário Gava Ferrão, Frederico de Pina Matta, Maria Amélia Gava Ferrão, João Cândido de Souza, Adelaide de F. S. da Costa, Liliâm Maria Ventorim Ferrão. 4 p. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| Registros recuperados : 199 | |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Corte. |
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Data corrente: |
07/03/2017 |
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Data da última atualização: |
07/03/2017 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
SALGADO, L. R.; CHIARI, L.; JANK, L.; SANTOS, M. F. |
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Afiliação: |
LEONARDO RIPPEL SALGADO, BOLSISTA - FUNDECT/CNPq; LUCIMARA CHIARI, CNPGC; LIANA JANK, CNPGC; MATEUS FIGUEIREDO SANTOS, CNPGC. |
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Título: |
Análise bioinformática do transcritoma de Panicum maximum Jacq. em resposta ao déficit hídrico. |
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Ano de publicação: |
2016 |
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Fonte/Imprenta: |
In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 12., 2016, Campo Grande, MS. p. 72-73. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Entre as principais espécies forrageiras tropicais utilizadas nas pastagens brasileiras, Panicum maximum merece destaque devido a sua alta produtividade e qualidade de forragem. Entretanto, as cultivares disponíveis desta espécie apresentam acentuada redução de produtividade nos períodos de seca e veranicos. Neste projeto, a técnica de RNA-Seq foi utilizada para obter o transcritoma de folhas de P. maximum sob diferentes condições de estresse para buscar elucidar os mecanismos de tolerância relacionados à resposta a este estresse. Para tanto, foi conduzido um ensaio de estresse hídrico com os genótipos c10 (tolerante) e HBRS 1 (sensível) por oito dias com dois níveis hídricos (controle e estresse) e quatro pontos de coletas (controle, 1, 4 e 8 dias), usando um delineamento inteiramente casualizado com três repetições. Os cDNAS obtidos a partir da extração dos RNAs em triplicata dos dois genótipos foram sequenciados em sequenciador Illumina HiSeq2500. As bibliotecas foram preparadas para sequenciamento do tipo pair end (101 bp) com uma cobertura desejada de 8 milhões de reads por biblioteca. Após demultiplexing, os arquivos no formato .fastq foram utilizados como entrada para montagem do transcritoma utilizando diferentes configurações do software Trinity RNA-Seq De novo Assembler e depois compilados em um transcritoma compreensivo pelo Evidential- Gene Transcript Assembly Software. O transcritoma compreensivo foi gerado a partir de cinco outras montagens resultando em um total de 60,701 transcritos e 61,576 sequências de aminoácidos. A partir destes transcritos obteve-se 12.605 marcadores microssatélites variando em tamanho do motivo de uma até seis repetições. Este é um trabalho em andamento, que culminará com a identificação de genes diferencialmente expressos em resposta ao déficit hídrico. No entanto, com os resultados obtidos até o momento disponibiliza-se um grande números de marcadores moleculares do tipo SSR, que após validados, podem ser usados amplamente nos programas de melhoramento genético de cultivares de Panicum maximum e espécies geneticamente próximas. MenosEntre as principais espécies forrageiras tropicais utilizadas nas pastagens brasileiras, Panicum maximum merece destaque devido a sua alta produtividade e qualidade de forragem. Entretanto, as cultivares disponíveis desta espécie apresentam acentuada redução de produtividade nos períodos de seca e veranicos. Neste projeto, a técnica de RNA-Seq foi utilizada para obter o transcritoma de folhas de P. maximum sob diferentes condições de estresse para buscar elucidar os mecanismos de tolerância relacionados à resposta a este estresse. Para tanto, foi conduzido um ensaio de estresse hídrico com os genótipos c10 (tolerante) e HBRS 1 (sensível) por oito dias com dois níveis hídricos (controle e estresse) e quatro pontos de coletas (controle, 1, 4 e 8 dias), usando um delineamento inteiramente casualizado com três repetições. Os cDNAS obtidos a partir da extração dos RNAs em triplicata dos dois genótipos foram sequenciados em sequenciador Illumina HiSeq2500. As bibliotecas foram preparadas para sequenciamento do tipo pair end (101 bp) com uma cobertura desejada de 8 milhões de reads por biblioteca. Após demultiplexing, os arquivos no formato .fastq foram utilizados como entrada para montagem do transcritoma utilizando diferentes configurações do software Trinity RNA-Seq De novo Assembler e depois compilados em um transcritoma compreensivo pelo Evidential- Gene Transcript Assembly Software. O transcritoma compreensivo foi gerado a partir de cinco outras montagens resultando em um tot... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Déficit hídrico. |
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Thesagro: |
Panicum maximum; Pastagem. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/157227/1/Analise-bioinformatica.pdf
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Marc: |
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700 1 $aSANTOS, M. F.
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Embrapa Gado de Corte (CNPGC) |
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